MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Enterococcus faecium DO plasmid 1

Total Repeats: 128

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017961	TGT	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017961	TA	3	6	1936	1941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017961	T	6	6	1973	1978	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017961	AGG	2	6	2004	2009	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017961	AATT	2	8	2010	2017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_017961	AATG	2	8	2027	2034	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017961	ATT	2	6	2096	2101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017961	GA	3	6	3513	3518	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017961	AAT	2	6	3718	3723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017961	AGG	2	6	3737	3742	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017961	TTTA	2	8	4459	4466	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017961	TGT	2	6	5887	5892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017961	ATA	2	6	5898	5903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_017961	T	7	7	5904	5910	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017961	A	6	6	5930	5935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_017961	CAT	2	6	6004	6009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017961	AT	3	6	6008	6013	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017961	ACA	2	6	6043	6048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017961	TAG	2	6	6282	6287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_017961	ACCA	2	8	6734	6741	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_017961	TAG	2	6	6749	6754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017961	ATG	2	6	6835	6840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017961	T	7	7	6853	6859	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017961	CTT	2	6	6883	6888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017961	CCT	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_017961	GTT	2	6	7250	7255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017961	AAT	2	6	7256	7261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017961	TCA	2	6	7262	7267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017961	GAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017961	CTA	2	6	7615	7620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_017961	TCG	2	6	7626	7631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017961	TGT	2	6	8867	8872	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_017961	AGGATT	2	12	8901	8912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017961	AGTA	2	8	8930	8937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017961	AT	3	6	8944	8949	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017961	TACT	2	8	8965	8972	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_017961	AT	3	6	10204	10209	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017961	AT	3	6	10231	10236	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017961	AT	3	6	10240	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017961	AT	3	6	10306	10311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017961	AT	3	6	10333	10338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017961	AT	3	6	10352	10357	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017961	A	8	8	10482	10489	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_017961	AAT	2	6	10498	10503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017961	ATT	2	6	10521	10526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017961	ACT	2	6	10589	10594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_017961	A	7	7	10643	10649	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017961	AGA	2	6	10665	10670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017961	TTTA	2	8	10674	10681	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017961	TTAAA	2	10	10688	10697	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017961	AG	3	6	10714	10719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017961	TTTG	2	8	10763	10770	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_017961	AT	3	6	12313	12318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017961	GGT	2	6	12365	12370	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017961	GGA	2	6	12406	12411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017961	TTTA	2	8	12720	12727	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017961	ACTC	2	8	13702	13709	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_017961	T	6	6	13756	13761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017961	A	7	7	15080	15086	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017961	AAAT	2	8	15122	15129	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017961	AGG	2	6	15185	15190	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_017961	GTA	2	6	15191	15196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017961	GGA	2	6	15242	15247	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_017961	TAAGAA	2	12	15261	15272	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_017961	CTA	2	6	15344	15349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_017961	AAT	2	6	15363	15368	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017961	TTTA	2	8	16104	16111	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017961	T	6	6	16218	16223	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017961	TCT	2	6	16230	16235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_017961	A	6	6	16237	16242	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017961	TAC	2	6	16243	16248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_017961	C	6	6	16288	16293	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
73	NC_017961	T	7	7	16318	16324	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_017961	T	6	6	16330	16335	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_017961	A	8	8	16341	16348	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_017961	CA	3	6	16404	16409	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_017961	GT	3	6	16430	16435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017961	TACTT	2	10	16438	16447	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_017961	A	7	7	17781	17787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_017961	T	7	7	17805	17811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017961	TTCT	2	8	17828	17835	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_017961	TTTTA	2	10	17865	17874	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_017961	GTAT	2	8	17902	17909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017961	CAAA	2	8	17982	17989	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_017961	TCC	2	6	19631	19636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_017961	TAT	2	6	19650	19655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_017961	TAG	2	6	19670	19675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017961	AAT	2	6	19720	19725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_017961	ATTTCT	2	12	19736	19747	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_017961	ATT	2	6	19751	19756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017961	CTT	2	6	19761	19766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017961	CAT	2	6	20409	20414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_017961	ACA	2	6	20541	20546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_017961	CCT	2	6	20597	20602	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_017961	TAC	2	6	21459	21464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_017961	TAC	2	6	21470	21475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_017961	ATGA	2	8	21478	21485	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017961	ACG	2	6	21494	21499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_017961	AG	3	6	22037	22042	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017961	AG	3	6	25256	25261	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017961	TAA	2	6	25330	25335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017961	TTA	2	6	25354	25359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017961	ATG	2	6	25386	25391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017961	TGA	2	6	25497	25502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017961	AT	3	6	25505	25510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017961	CAG	2	6	25734	25739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_017961	AT	4	8	25762	25769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017961	TCA	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017961	GAA	2	6	25832	25837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017961	GGA	2	6	25903	25908	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_017961	TA	3	6	25925	25930	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_017961	TAT	2	6	25940	25945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017961	GTT	2	6	25946	25951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017961	A	6	6	25975	25980	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_017961	CTCA	2	8	25982	25989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_017961	CTA	2	6	27928	27933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_017961	G	6	6	28003	28008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017961	AT	3	6	28050	28055	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_017961	AAAG	2	8	28351	28358	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017961	A	6	6	35939	35944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017961	TAT	2	6	35979	35984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_017961	TAA	2	6	36008	36013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017961	TAAA	2	8	36033	36040	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017961	AAT	2	6	36064	36069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017961	T	6	6	36079	36084	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017961	AGG	2	6	36085	36090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_017961	T	6	6	36097	36102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017961	GGA	2	6	36250	36255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.